О технологии

Описание технологии KASP

Патентованная технология KASP™ для генотипирования методом ПЦР представляет собой однородную флуоресцентную (FRET) методику для точного распознавания биаллельных полиморфизмов типа SNP и Вставки/Делекции. В отличие от других ПЦР-методик генотипирования, KASP экономически выгодная методика, так как не требует использования дорогостоящих меченых целевых праймеров/зондов. Одним из преимуществ KASP является высокая гибкость при дизайне эксперимента, что гарантирует повышенную результативность и дает уникальную возможность для идентификации крупных Вставок/Делеций в т.ч. длиной до 200 000 п.о.

Почему используют KASP?

Простота и удобство дизайна эксперимента KASP выражаются в целом ряде преимуществ для пользователя:

Сверхвысокая точность и эффективность

  • Точность:  >99.8% на основании независимых оценок
  • Лидирующая коммерческая технология по уровню конверсии >90% для SNP & Вставки/Делеции

Невероятная гибкость

  • Гибкий дизайн праймеров повышает вероятность достоверных результатов экспреримента
  • Работает с проектами любого масштаба (низкая и высокая производительность), возможность повтора отдельных реакций
  • Совместимость с множеством роботизированных и термоциклеров, для детекции флуоресценции можно использовать qПЦР-термоциклер или FRET-ридер микропланшетов от большинства известных производителей.

Экономичность

  • В реакции KASP используется универсальная система репортинга, меченые компоненты которой входят в состав мастер-микса
  • Для реакции не требуется использовать дорогостоящиие меченые праймеры или зонды
  • Достаточно всего 10 нг ДНК для анализа 1 SNP в одном образце (расчитано на основе размера генома человека)
  • Малый объем реакционной смеси снижает расход реагентов
  • Высокое качество результатов, больше экспериментов при минимальной стоимости

Технология генотипирования KASP изначалньо была разработана для нужд аутсорсинг-лаборатории LGC Genomics и зарекомендовала свою эффективность на протяжении уже более 10 лет, постоянно совершенствуясь. Более 2,000 публикаций выпущено, где упоминается технология KASP. Попробуйте KASP в виде коммерческого набора реагентов (KBD — KASP by Design) для Ваших экспериментов или воспользуйтесь услугами по генотипированию образцов.

Ключевое свойство технологии KASP — использование репортерной системы на основе FRET-кассет, что исключает применение дорогостоящих меченых зондов и праймеров. В реакции KASP применяются аллель-специфичные праймеры с заданной концевой последовательностью, которые соответствуют одной из двух FRET-кассет: один меченый красителем FAM, другой — HEX. Эта технология имеет существенные преимущества в низкой стоимости и в сочетании с микрообъемами реакционной смеси (10 мкл/лунку, 96 лунок, 5 мкл / лунку, 384 лунки;  1 мкл / лунку, 1536 лунок) представляет собой исключительно точное, гибкое и экономичное решение для генотипирования.  Распознавание биаллельных полиморфизмов осуществляется за счет конкурентного связывания двух аллель-специфичных прямых праймеров.

Для KASP требуется стандартное оборудование

Рабочий процесс KASP подразумевает использование открытых ПЦР-систем.  Для работы с KASP в Вашей лаборатории не требуется закупать дорогостоящего оборудования. Для считывания результатов реакции KASP можно использовать практически любой FRET-ридер микропланшетов или qПЦР-систему.