Библиотеки KASP-маркеров

Компания LGC Genomics

Валидированные библиотеки SNP-маркеров для генотипирования методом KASP:

Человек 

  • Human Assay Search Tool -  более 14 000 валидированных SNP-маркеров  генома человека. Поиск по rs# и положению на хромосоме.
  • Human exome sample tracking panel — панель из 24  SNP для валидации экзомных исследований методом секвенирования.

Сельскохозяйтсвенные растения

  • Пшеница

Wheat genotyping library — библиотека SNP-маркеров пшеницы, разработанная в сотрудничестве с CYMMIT,  Integrated Breeding Platform (IBP) и Бристольским Университетом. Assay Search tool — инструмент поиска по 9600 функциональным маркерам, которые используются исследователями и селекционерами для идентификации генетических маркеров, связанных с ключевыми фенотипами для проведения маркер-вспомогательной селекции (MAS).

  • Кукуруза

Maize genotyping library - библиотека SNP-маркеров пшеницы, разработанная для Глобальной Программы по Кукурузе (CIMMYT) и Generation Challenge Programme. Assay Search Tool — инструмент поиска по 1,200 функциональным маркерам генома кукурузы.

  • Соя

Soybean genotyping library библиотека SNP-маркеров сои разработанная в рамках сотрудничества LGC с Generation Challenge Programm и Integrated Breeding Platform. Assay Search Tool - сайт поиска по 1000 маркерам сои.

  • Рис

Rice genotyping library библиотека маркеров сои, разработанная в рамках сотрудничества LGC с Generation Challenge Programm и Integrated Breeding Platform. Assay Search Tool — сайт поиска по 2000 маркерам риса.

  • Томат

Tomato genotyping library  - библиотека SNP-маркеров томата , разработанная в рамках сотрудничества LGC с Solanaceae Coordinated Agricultural Project (SolCAP). Assay Search Tool — сайт поиска по 7000 маркерам генома томатов.

  • Чечевица

Lentil genotyping panel — библиотека SNP-маркеров чечевицы, разработанная в рамках сотрудничества LGC с Pulse Crop Research Group в Университете Саскачевана. Assay Search Tool — сайт поиска по 146 маркерам генома чечевицы.

  • Фасоль обыкновенная

Common bean genotyping panel - библиотека SNP-маркеров фасоли содержит 1500 валидированных маркеров.

Модельные животные

  • Мышь

Mouse genotyping library — библиотека SNP-маркеров генома мыши, которая насчитывает 1638 валидированных маркеров, адаптированных для генотипирования большинства известных мышиных линий.

 

  • Крыса 

Rat genotyping library — библиотека SNP-маркеров генома мыши, которая насчитывает 820 валидированных маркеров, адаптированных для генотипирования большинства известных линий. Это эффективный инструмент для картирования линий  These assays are powerful tool for the mapping of traits within rat disease models and breeding populations.

  • Зебрафиш

Zebrafish genotyping library — библиотека SNP-маркеров зебрафиш, разработанная в сотрудничестве с Институтом Хюбрехта и Институтом Сэнгера как часть проекта Zebrafish Mutation Project. Библиотека содержит 1073 валидированных функциональных SNP-маркеров зебрафиш.